Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uhrf2Q7TMI3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms