Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF2

Eri1, 3'-5' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri1Q7TMF2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms