Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScocQ78YZ6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms