Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpopQ6ZWS8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms