Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnih3Q6ZWS4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms