Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ino80Q6ZPV2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms