Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl3Q6W5C0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms