Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift172Q6VH22 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift172Q6VH22 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms