Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gja6Q6S5G4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms