Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnip1Q6QD59 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnip1Q6QD59 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms