Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nudcd1Q6PIP5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nudcd1Q6PIP5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms