Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med16Q6PGF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med16Q6PGF3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms