Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmeff1Q6PFE7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmeff1Q6PFE7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms