Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc36Q6PDM4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc36Q6PDM4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms