Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mfsd4aQ6PDC8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms