Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms