Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb40Q6PCS8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb40Q6PCS8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms