Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCL9

Papolg, Poly(A) polymerase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolgQ6PCL9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PapolgQ6PCL9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolgQ6PCL9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms