Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Lce3fQ6PAI4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms