Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms