Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rrp12Q6P5B0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms