Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Wdr44Q6NVE8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms