Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc66Q6NS45 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc66Q6NS45 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms