Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg16l2Q6KAU8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms