Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msl2Q69ZF8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Msl2Q69ZF8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms