Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms