Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sptbn2Q68FG2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sptbn2Q68FG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms