Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fnip1Q68FD7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms