Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrp4fQ66X05 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4fQ66X05 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms