Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CilpQ66K08 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms