Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrrc8eQ66JT1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms