Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf2Q64705 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms