Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja3Q64448 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja3Q64448 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms