Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms