Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc18Q640L5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc18Q640L5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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