Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms