Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vat1Q62465 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms