Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Hoxa13Q62424 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxa13Q62424 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Hoxa13Q62424 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxa13Q62424 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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