Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epha6Q62413 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha6Q62413 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms