Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtmQ62388 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtmQ62388 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtmQ62388 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtmQ62388 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
AtmQ62388 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms