Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf6Q62311 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms