Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ss18Q62280 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ss18Q62280 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ss18Q62280 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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