Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SypQ62277 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SypQ62277 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SypQ62277 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SypQ62277 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms