Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sos1Q62245 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sos1Q62245 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sos1Q62245 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms