Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rbm38Q62176 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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