Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprrQ62132 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprrQ62132 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms