Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtafrQ62035 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtafrQ62035 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms