Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pcbp2Q61990 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms