Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms