Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Erbb3Q61526 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Erbb3Q61526 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms